简介
ATACdb 是一个专注于预测人类染色体开放状态的数据库。它利用了多种高通量技术，如 ATAC-seq、DNase-seq、FAIRE-seq 和 MNase-seq 等，来研究染色质的可及性。其中，ATAC-seq 因其性价比高和敏感性高而成为最受欢迎的技术之一。
主要功能
ATACdb 收集并统一分析了目前网上所有可获得的 ATAC-seq 数据，按照标准化流程进行处理。
数据浏览：用户可以查看数据库中包含的 ATAC-seq 数据，并通过点击 Sample ID 访问特定样本的全部结果。
目标检索：提供基于研究目的的检索，包括：
转录因子检索
目标基因检索
基因组位置检索
相关组织检索
分析功能：用户可以分析和比较不同组织来源的细胞测序结果，寻找差异或重叠区域，以及两个转录因子共同作用的区域。
数据下载：提供数据下载功能，方便用户进行进一步的本地分析。
使用方法
数据浏览：在数据浏览部分，用户可以查看数据库纳入的 ATAC-seq 数据概览，并获取样本的详细分析结果。
目标检索：用户根据自己的研究目标选择合适的检索方式，以获取相关数据。
分析功能：用户可以利用数据库提供的分析工具，对特定条件下的 ATAC-seq 结果进行比较和分析。
结论
ATACdb 作为一个预测染色质开放状态的数据库，为研究者提供了一个宝贵的资源，用以探索染色质可及性及其在生物学过程中的作用。它的数据浏览、检索、分析和下载功能，使得研究者能够高效地获取和分析 ATAC-seq 数据。
