一、植物样本
1. 植物组织样本说明
1.1 植物主要包括禾本科植物、十字花科植物、常见作物、林木、常见蔬菜和花卉、中药、蕨类或苔藓。
1.2 样本的取材优先选择核酸含量相对较高的组织。幼嫩的组织最佳，如幼叶，幼芽。可用组培苗但不推荐冷冻保存的组织。建议优先采集新鲜组织样品，采样时尽量避免保存过久的组织样本和反复冻融的组织样本。
2. 样本制备运输注意事项
2.1 建议在采集样本之前，将样本置于黑暗环境24 ~ 48 h后再取材。如果需要立即取材，请尽快采集好样本后，迅速置于低温保存或运输，减少植物中化合物的氧化对核酸的影响。
2.2 对于有特殊组织部位要求的样品，在采样之前需做好样品分离处理，尽量避免活体植物。
2.3 建议采用带有螺口的冻存管，管壁上标明样品名称；自封袋可以留剪刀口后折叠封存；一般不建议离心管，不得已用离心管时，离心管口需用封口膜封死。
2.4 组织样品大小在满足提取总量所需基本要求外，尽量使样品易于取出，具体体现为锡纸折叠整齐有条理，不要团成团；自封袋分类合理有效，不要多余分装；冻存管中样品不宜塞满，如果为多次提取提供样品，建议分装。
3. 样本制备方法
3.1 新鲜组织样：
3.1.1 组织取样前准备好足够的冰袋，写好样品名称编号的合适大小的自封袋和锡纸。
3.1.2 取样时尽量保留叶柄，使用无菌水或75%乙醇擦拭或冲洗干净，用潮湿的吸水性较好的纸或纱布包裹，不要让材料干枯，但不能太湿，以免泡坏样品。材料珍贵的样品，将一片片叶片分开包裹，不要重叠，以防叶片烂毁浪费。
3.1.3 新鲜材料的运输，从-20℃取出的冰袋不要直接接触样品，以免造成保湿用纸结冰，导致样品局部冻伤。
3.2 冻存组织样：
3.2.1 组织取样前准备好足够的液氮，写好样品名称编号的合适大小的自封袋、锡纸或者冻存管。
3.2.2 迅速取下合适大小的新鲜的植物组织部位，使用无菌水或75%乙醇擦拭或冲洗干净，再用吸水纸吸干样品表面后,迅速浸没于液氮中。
3.2.3 将组织样品从液氮取出放入准备好的自封袋、锡纸或者是预冷的冻存管中。再次将样品进行液氮冷冻后放入足量干冰箱寄送或置于-80°C保存。
3.2.4 植物组织采样量建议
0.5 g对应植物为9cm2叶片，略大于一元硬币大小。
WGS 文库至少 0.2 g，GBS文库至少 0.5 g，RAD文库 至少1 g，总体建议 2 g 以上。
二、动物样本
1. 动物样本采样说明
1.1 动物主要包括脊椎动物、节肢动物和水产类，涵盖常规的哺乳动物、鸟类、爬行动物以及两栖动物，昆虫和虾蟹类动物等。
1.2 需要选择新鲜的样本，优先采集核酸含量相对较高的组织，测序尽量避免用保存过久的组织样本和反复冻融的组织样本，特别是动物肝脏，脾脏，肾脏，心脏，脂肪，脑，肿瘤等有较高DNA酶活性的组织。
2. 样本制备运输注意事项
2.1 对于有特殊组织部位要求的样品，需做好样品分离、解剖等处理。
2.2 样品分割和处理时应在冰上进行，防止样品降解。
2.3 组织样品大小在满足提取总量所需基本要求外，尽量使样品易于取出，具体体现为锡纸折叠整齐有条理，不要团成团；自封袋分类合理有效，不要多余分装；冻存管中样品不宜塞满，达到容量的80%即可。如果为多次提取提供样品，建议根据提取次数分装。
3. 样本制备方法
3.1 组织取样前准备好足够的液氮、冰袋等，写好样品名称编号的合适大小的自封袋、锡纸或者冻存管，管盖须钻孔（防止管内液氮体积膨胀爆炸），并在冻存管内加满液氮。
3.2 迅速取下适量的新鲜的动物组织，用预冷的生理盐水进行漂洗，以去除血渍和污物，并剔除结缔组织和毛发等非研究组织，将样品分割成50 mg左右的小块（约黄豆大小），立即浸入装有液氮的冻存管中彻底冷冻，再将样品放入足量干冰箱寄送或置于-80℃保存。
3.3 无法使用冻存管采集保存的样品，离体后仍需将样品立即浸入液氮彻底冷冻，再选用合适的容器包装，包装后需再浸入液氮中彻底冷冻一次，最后将样品放入足量干冰箱寄送或置于-80°C保存。
4. 特殊样本注意事项
4.1 昆虫样本
昆虫污染较为严重，需额外进行以下处理：
4.1.1 饥饿处理：根据物种饥饿耐受情况，饥饿6 ~ 48 h。
4.1.2 喂食抗生素：昆虫尽量使用广谱抗生素或者近缘物种报道过的无菌品系构建所使用的抗生素种类、浓度，处理天数2 ~ 5 d，可视物种情况而定。
4.1.3 去除肠道或整个腹部，保留胸部、头部提取。
4.1.4 表面消毒：75%乙醇浸泡1 ~ 2 min，无菌水漂洗1 ~ 2次，滤纸吸干后速冻。
4.2 甲壳动物、软体动物和刺胞动物样本
4.2.1甲壳动物（虾类和蟹类等）&软体动物（海绵和海参等）&刺胞动物（珊瑚等）采样前需额外使用75%的乙醇进行漂洗。
4.2.2 针对刺胞动物，可去除头部和肠道等部位，保留肌肉外壁用于提取。
5. 动物样本采样量
动物组织 WGS 文库样品量应大于 0.1g；RAD-seq文库量大于0.5 g；GBS-seq文库量大于0.5 g。
三、血液样本
1. 血液样本说明
新鲜血样或是冻存血样均需要使用EDTA抗凝管进行采集并与抗凝剂充分混合，血液样本不建议保存时间过长，新鲜血液不超过24 h，冻存血液不超过1年。
2. 血液样本要求
动物血液（哺乳类）： WGS ≥ 1 mL，RAD-seq ≥ 1 mL， GBS-seq ≥ 1 mL
动物血液（红细胞有核类）： WGS ≥ 0.5 mL，RAD-seq ≥ 0.5 mL，GBS-seq ≥ 0.5 mL
2.1 要求为全血样本，并加入抗凝剂，推荐使用EDTA抗凝的采血管收集样品（由于会影响实验，不能使用肝素抗凝）。
2.2 血液样本避免反复冻融。因放置过久或经历过反复冻融的样本经常会发生细胞核破裂，核酸游离于血浆中。加入抗凝剂后的新鲜血液一般可以在4℃放置12 ~ 24 h，但经过速冻后的样本一定要低温保存。
2.3 血液样品应使用塑料材质的采血管，不宜装满、达到80%容量即可。应避免使用玻璃材质采血管或装液太满，以至冻裂。
3. 样本保存要求
3.1 动物或人新鲜血液样本
3.1.1 用EDTA管采集血液。采集后的血液可放置到采血管混匀仪室温混匀15 min，或手动轻柔缓慢颠倒混匀15次，确保无凝血现象。
3.1.2 采血用封口膜封口后保存在4℃，使用4℃冰袋运输（请勿使用-20 ℃冰袋）。
3.2 鱼血（或水生动物血液）样本
新鲜采取的血液，要加抗凝剂，抗凝剂可以根据自己平常的研究来确定。采样后，在-80℃保存。
3.3 冷冻血液采集及预处理指南
推荐将采集后充分抗凝的血液进行分装，以便进行后续储存和运输。分装650 µL ~ 1 mL全血（针对不含有带核红细胞的血液）。一次提取仅需要一管分装血液，额外准备一管作为备份。将血液抽取到EDTA管中，采集后的血液，可放置到采血管混匀仪室温混匀15 min。或手动缓慢混匀15次，保证与抗凝剂的充分混匀，确保无凝血现象。
将血液进行分装，每个冻存管分装650 µL ~ 1 mL血液。将每份血液迅速放到-80℃冰箱冷冻。如条件不具备的话，最晚在采血后4 d内完成冷冻。
3.4 样本运输要求
3.4.1 新鲜血液打包运输指南：
(1)将采血管放入密封袋中，塑料袋内放置吸水纸（吸附意外的泄露）。切勿用纸巾包裹采血管。
(2)使用泡泡纸松松地包裹密封袋。不要用胶带直接包裹或钉密封袋。
(3)将打包好的采血管放入体积足够的聚苯乙烯泡沫箱中，放入足够的冰袋（4℃），保证运输过程低温。如有需要，加入缓冲材料。使用最快速的运输服务进行运输。
3.4.2 冷冻血液打包运输指南
(1)分装后的冷冻管口需用封口膜包裹，将所有样品管放到密封袋中。
(2)用泡泡纸松松地包裹密封袋，不要用胶带直接包裹或钉密封袋。
(3)使用可放下合适体积的干冰和样品的聚苯乙烯泡沫箱，确保运输过程干冰量足够。使用最快速的运输服务进行运输。
4. 细胞样本
4.1 细胞样本要求
4.1.1 细胞采样量>5*106 ，优先选择生长对数期细胞，若细胞贴壁培养，需要去除培养基，使用胰酶消化；
4.1.2 PBS悬浮消化后的细胞，转入冻存管，离心去除上清；
4.1.3 立刻液氮速冻15min，-80保存，干冰保存运输；
4.1.4 不建议冻存未复苏的细胞
5. PCR产物
5.1 组织样本
植物组织：PCR-free文库350bp (基因组) >3g， PCR-free文库非350bp （基因组）>3g
动物组织：PCR-free文库350bp (基因组) >1.5g ，PCR-free文库非350bp （基因组）>1.5g
细胞：PCR-free文库350bp (基因组)>8*108个 ，PCR-free文库非350bp （基因组）>8*108个
动物血液(哺乳类)：PCR-free文库350bp (基因组)>5mL ，PCR-free文库非350bp （基因组）>5mL
动物血液(红细胞有核类)：PCR-free文库350bp (基因组)>3mL ，PCR-free文库非350bp （基因组）>3mL
唾液：PCR-free文库350bp (基因组)>10mL ，PCR-free文库非350bp （基因组）>10mL
菌液(对数生长期)：PCR-free文库350bp (基因组)>5mL ，PCR-free文库非350bp （基因组）>5mL
土壤：PCR-free文库350bp (基因组)3mL ，PCR-free文库非350bp （基因组）3mL
粪便、肠道内容物、食糜：PCR-free文库350bp (基因组)>2mL ，PCR-free文库非350bp （基因组）>2mL
瘤胃液：PCR-free文库350bp (基因组)>2mL ，PCR-free文库非350bp （基因组）>2mL
水体(滤膜) PCR-free文库350bp (基因组)直径4cm滤膜3张 ，PCR-free文库非350bp （基因组）直径4cm滤膜3张
拭子 PCR-free文库350bp (基因组)>10个 ，PCR-free文库非350bp （基因组）>10个
5.2 核酸样本
5.2.1 PCR产物要经过纯化（如胶回收纯化），确保条带单一，无降解，无引物二聚体
5.2.2 使用干冰或冰袋运送
5.2.3 PCR产物构建pcr-free文库时，PCR产物不可以加illumina测序接头（P5、P7序列、搭桥序列）
扩增子（pcr产物单建库）： 体积在20μl~120μl， 总量 >1500ng。
PCR-free文库 350bp： 浓度>24ng/μL，体积在 20μl~120μl，总量>2μg。
PCR-free文库非350bp： 浓度>24ng/μL，体积在 20μl~120μl，总量 >5μg。
