一、原核转录组

1. 菌体样本

(1) 建议采样量:菌体细胞>1*107个或菌体>0.5g

(2)建议收集液体培养基中对数生长期的菌体

(3)通过低速离心收集菌体并尽可能将培养基去除干净,然后用无菌水或PBS缓冲液冲洗样品1~3遍,保留菌液沉淀

(4)不建议用RNAlater保存,因为RNAlater密度较大,取时不易分离菌体

(5)不建议加入裂解液,细菌的提取一般使用试剂盒

(6)不建议加TRIzol,影响菌体裂解

2. 核酸样本

(1)针对核酸有杂质、污染、粘稠、颜色等情况,需要过柱纯化或者酌情增加采样量

(2)核酸样品建议使用1.5ml、2ml EP管装载样品,其他保存管容易破裂且不利于保存样品和后续实验的开展

(3)为了防止样品污染和混淆,禁止使用96孔板和深孔板装载样品

(4)用乙醇沉淀的样品由于运输中会有少量乙醇挥发,建议将样品管盖用封口膜缠绕4-5圈


total RNA :浓度 ≥ 50ng/μL,体积在20μL ~ 120μL,总量 ≥ 1μg

菌体/菌丝: ≥ 1*107 个/≥ 0.5g

二、样本打包

1. 样本的打包

(1)核酸样品建议使用质量好的1.5ml或2ml 低吸附EP管装载样品,并用封口膜封口。为了防止样品管破裂,或者污染和混乱,不要使用诸如PCR管、0.5ml EP管、八联管、96孔板、深孔板等非标准管。非标准管不利于样品保存以及后续实验的进行。

(2)组织样本建议根据采样量使用合适规格带螺纹帽的EP管、冻存管或者离心管装载组织样品,并用封口膜封口。

(3)为防止样品管在运输过程中受到干冰挤压破裂,最好将样品管放到50ml离心管或其他支撑物中,并在支撑物里添加棉花或卫生纸缓冲。大量样品建议将EP管放置在冻存盒中,并在冻存盒外面包裹气泡垫。如使用锡箔纸、自封袋装载的样品,为防止运输中受挤压破损,建议将锡箔纸折叠整齐装在自封袋中,在样品包装外再用气泡垫包好并固定。

(4)对于血液样品,建议采用5-10ml 塑料抗凝采血管装载,为了防止运输过程中采血管因挤压而损坏,需要将每支采血管管身均用气泡垫包好,然后放置到塑料或纸质包装盒中。

(5)用乙醇沉淀的样品由于运输中会有少量乙醇挥发出,建议将样品管盖用封口膜缠绕4-5圈。

2. 样本的名称标识

(1)所有的样品必须具有清晰的标记,并且简洁明了。

(2)使用锡箔纸包装的组织样品建议在锡箔纸内外均标记样品名称,并将锡箔纸放在自封袋中,自封袋外面再标记上样品名称,防止锡箔纸上样品名称模糊引起样品混乱。

(3)使用乙醇沉淀的核酸样品,由于挥发出的乙醇会使记号笔的标记模糊,建议用油性记号笔将样品名称写在标签纸上,然后用透明胶带将标签纸粘贴在样品管壁上,并缠绕2-3圈。

(4)样品名称建议使用“字母+数字”命名方式标注在管盖。其他信息如日期、浓度、物种等可标注在管壁。所有标注内容需与《样品信息单》保持一致。