简介
ChEA3（ChIP-X Enrichment Analysis 3）是一种转录因子预测分析工具。它对与用户提交的基因集相关的转录因子（TF）进行排名。ChEA3背景数据库包含从多个来源生成的基因集库集合，包括来自RNA-seq研究的TF-基因共表达，来自ChIP-seq实验的TF-target关联，输入想寻找的基因，它就会自动为你预测可能的上游调控转录因子。
主要功能
转录因子预测：输入需要预测的基因，ChEA3会预测可能的上游调控转录因子。
富集分析：对用户提交的基因集进行转录因子富集分析。
数据可视化：提供不同的可视化选项，如Global Network, Local Network, Bar Chart, Clustergram。
数据来源：整合了来自多个数据库和文献的数据。
主要特点
用户友好：界面清爽，操作简便。
快速响应：提交基因集后，ChEA3能快速给出预测结果。
多源数据：整合了来自不同来源的数据，提高了预测的准确性。
排名依据：提供基于不同数据来源的转录因子排名。
结论
ChEA3是一个实用的转录因子预测数据库，它通过整合多个来源的数据，为研究人员提供了一个快速、准确的转录因子预测工具 。ChEA3的用户友好界面和快速响应时间使得它成为生物信息学研究中一个受欢迎的资源。此外，ChEA3的多源数据整合和排名依据为研究人员提供了更全面的视角来理解基因调控网络。
