简介

Oviz-Bio 是一个基于 Web 的交互式癌症基因组数据可视化平台,它在癌症基因组研究的知识共享中起着重要作用 。该平台提供实时且互动的可视化效果,允许研究人员探索视觉输出并导出高质量的图表 。

主要功能

多种癌症突变类型的可视化:包括小规模突变的注释和签名、单倍型视图和拷贝数变异的焦点簇、结构变异的拆分读取比对和热图视图、融合基因的转录连接以及癌病毒整合的基因组热点 。

景观视图:用于研究样本队列中的多层数据 。

用户交互:用户可以通过交互式图表进行数据探索,并且可以根据用户输入文件自动生成图表 。

数据格式支持:支持 VCF、MAF、BED 等常用数据格式,同时接受 PatchWork、GISTIC、SOAPfuse 和 SvABA 等突变检测工具的输出 。

主要特点

交互性:Oviz-Bio 提供了丰富的交互功能,包括提示工具、缩放和其他选项,使用户能够更深入地探索数据 。

实时可视化:平台能够提供实时的可视化效果,允许用户即时查看和调整他们的数据展示 。

高度可定制:用户可以根据自己的需求调整展示布局和外观,切换数据集和查询数据细节 。

无需编程经验:Oviz-Bio 拥有用户友好的图形界面,无需用户具备丰富的编程经验即可使用 。

结论

Oviz-Bio 是一个功能强大且用户友好的癌症基因组数据可视化工具,它通过提供多种交互式可视化选项,使得癌症基因组数据的探索和展示变得更加容易和直观。该平台的开放性和易用性使其成为癌症研究领域内一个宝贵的资源 。