简介

Oviz-Bio是一个专为交互式癌症基因组数据可视化而设计的Web平台。该平台提供了实时在线可视化突变分析,这些分析在人类癌症研究中被广泛使用。Oviz-Bio支持11种常见癌症突变的流行分析,包括小规模突变的注释、拷贝数变异的单倍型图,结构变异的分裂读取对齐和热图。

主要功能

多种数据格式支持:平台支持VCF、MAF、BED、TSV和CSV等常用数据格式,以及Patchwork和GISTIC等工具的输出作为输入。

交互式图表生成:根据用户输入文件自动生成交互式图表,可以调整显示布局和外观,切换数据集和查询数据细节。

高质量图表导出:实时图表可以导出为高质量的图形,适用于发表。

丰富的可视化应用:Oviz-Bio提供了六类可视化,包括小规模突变、拷贝数变异、结构变异、融合基因、肿瘤病毒整合和多层数据的视图分析。

主要特点

交互性:每个可视化网页包含各种类型的交互、丰富的提示和侧边栏编辑器,由Oviz框架提供支持,该框架专为复杂的交互式数据可视化而设计。

实时性:平台提供实时在线可视化,用户可以即时探索视觉输出。

免费访问:Oviz-Bio的所有视觉应用都可以免费访问,无需注册。

多层面数据集成:特别是通过景观视图分析,Oviz-Bio允许在样本队列中调查多层数据。

结论Oviz-Bio作为一个交互式癌症基因组数据可视化的Web平台,为研究人员提供了一个强大的工具,以直观、交互的方式探索和分析癌症基因组数据。它的多样性、实时性和易用性使其成为癌症研究领域中一个宝贵的资源。