简介
RGI（Rice Genome Index）水稻基因数据库是一个专注于亚洲水稻材料的基因组数据库。该数据库收录了16个主要亚洲水稻材料的参考基因组，并统一处理了多个基因组和注释信息，为研究人员提供了一个全面的水稻基因组资源。
主要功能
基因组收录：收录了16个主要亚洲水稻材料的参考基因组。
非冗余基因组确定：共确定了119,783个非冗余基因组，代表整个亚洲水稻基因集。
数字正交基因指数（OGI）：建立了统一的OGI，表明基因在所有材料中的代表性。
查询和可视化工具：提供丰富的模块和工具，帮助研究人员查询和可视化水稻基因及其同源关系。
综合图文信息卡片：每个基因都有一张包含同源基因索引、序列和功能信息的“综合图文信息卡片”。
转录本结构和系统发育树展示：展示每个基因的转录本结构和系统发育树等内容。
主要特点
全面性：RGI数据库涵盖了广泛的亚洲水稻材料，提供了全面的基因组数据。
统一处理：对多个基因组和注释信息进行了统一处理，确保了数据的一致性和可比性。
非冗余基因组：通过确定非冗余基因组，减少了数据的冗余性，提高了数据的可用性。
同源关系分析：提供了同源基因索引，方便研究人员分析水稻基因的同源关系。
信息可视化：通过综合图文信息卡片和系统发育树等工具，提供了直观的信息展示方式。
结论
RGI水稻基因索引数据库是一个宝贵的资源，它为水稻基因组研究提供了一个全面、统一和易于访问的平台。通过提供非冗余基因组数据、同源关系分析工具和信息可视化功能，RGI极大地促进了水稻基因组学的研究和应用。随着数据库的不断更新和扩展，它将成为水稻基因组研究领域的重要工具。
