简介
MetaboAnalyst 是一个综合性的代谢组学数据分析平台，提供了一系列统计分析、生物标记物鉴定、通路分析、富集分析、网络分析、统计元分析、LC-MS 谱图处理、MS/MS 峰注释、功能分析以及因果关系分析等工具。该平台旨在帮助研究者深入理解代谢组数据，并从中发现生物学上有意义的信息。
主要功能
单因素统计分析：提供传统单变量方法和高维数据的显著性分析。
多变量统计分析：包括 PCA、PLS-DA、OPLS-DA 等多元统计方法。
聚类分析：提供树状图、热图、K-means 和 SOM 等聚类工具。
有监督分类：包括随机森林和支持向量机等分类方法。
生物标记物分析：基于 ROC 曲线的方法，包括单变量和多变量分析。
通路分析：整合通路富集和拓扑分析，支持多种物种。
富集分析：执行 MSEA，涵盖人类和哺乳动物代谢物集。
网络分析：探索代谢物、基因在生物网络中的作用。
统计元分析：跨多个研究识别稳健的生物标志物。
LC-MS 谱图处理：支持 LC-MS 光谱的峰值提取和注释。
MS/MS 峰注释：基于公共 MS2 数据库执行峰值注释。
功能分析：对 HR-MS 生成的非靶向代谢组数据进行功能分析。
因果关系分析：通过 mGWAS 测试代谢物与疾病之间的潜在因果关系。
剂量反应分析：为毒理学研究提供剂量反应分析工具。
功效分析：计算检测效应所需的最小样本数量和研究设计的功效。
使用方法
用户根据分析需求选择合适的模块。
输入相应的数据，如 SNP 信息、代谢物列表、基因组数据等。
利用 MetaboAnalyst 提供的工具进行数据分析和解释。
结论
MetaboAnalyst 是一个功能强大的代谢组学数据分析平台，它通过提供多种分析工具，帮助研究者从多角度探索和解释代谢组数据。无论是基础研究还是临床应用，MetaboAnalyst 都能提供有价值的支持。
