简介
MicrobiomeAnalyst 提供了一个用户友好的网页平台，使研究人员能够在不具备生物信息学背景的情况下，轻松进行微生物组数据的分析。该工具最初由 Jasmine Chong、Peng Liu、Guangyan Zhou 和 Jianguo Xia 等人开发，并在《Nature Protocols》上发表 。
功能
MicrobiomeAnalyst 包含多个功能模块，支持从数据预处理到统计分析、功能分析的全过程：
Marker-gene Data Profiling (MDP)：针对16S rRNA等标记基因数据进行分析。
Shotgun Data Profiling (SDP)：适用于宏基因组和宏转录组数据。
Projection with Public Data (PPD)：允许用户将数据与公共数据库进行比较分析。
Taxon Set Enrichment Analysis (TSEA)：对分类群集进行富集分析。
主要特点
易用性：MicrobiomeAnalyst 提供了直观的网页界面，用户通过简单的点击操作即可完成复杂的分析流程。
全面性：该工具整合了多种统计分析和可视化方法，覆盖了微生物组研究的多个方面。
实时分析：用户可以实时看到分析过程和结果，提高了分析的透明度和可重复性。
数据比较：通过 PPD 模块，用户能够将自己的数据与公共数据集进行比较，发现潜在的模式和差异。
功能预测：集成了如 PICRUSt 和 Tax4Fun 等算法，从标记基因数据推断微生物组的功能潜力。
结论
MicrobiomeAnalyst 是一个非常有用的资源，适用于希望进行微生物组数据分析的广大科研工作者。它不仅提供了全面的分析模块，还通过提供详尽的教程和文档，降低了用户的使用门槛。此外，MicrobiomeAnalyst 2.0 版本在原有基础上增加了新模块和功能，如原始数据处理、微生物组代谢组学分析和统计荟萃分析模块，进一步提升了其分析能力。
