简介
Protein Data Bank(PDB数据库)是一个存储生物大分子原子坐标和相关信息的公共数据库,由美国Brookhaven国家实验室于1971年创建,并由Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB)维护。
主要特点
PDB是目前最主要的收集生物大分子(蛋白质、核酸和糖)2.5维(以二维的形式表示三维的数据)结构的数据库,是通过X射线单晶衍射、核磁共振、电子衍射等实验手段确定的蛋白质、多糖、核酸、病毒等生物大分子的三维结构数据库。
使用场景
结构生物学研究:研究者利用PDB数据库中的原子坐标数据进行蛋白质结构分析。
药物设计:基于PDB中的蛋白质结构信息进行药物靶标研究和药物设计。
教育和培训:作为教学资源,帮助学生理解生物大分子的结构和功能。
生物信息学分析:利用PDB数据进行生物信息学建模和模拟。
结论
PDB蛋白质结构数据库是结构生物学领域的基石,为科研人员提供了一个宝贵的资源,用于研究生物大分子的三维结构。随着科学技术的发展和实验方法的进步,PDB数据库将继续扩展其数据收集,支持更多创新性研究。通过PDB,研究者能够深入了解生物分子的结构基础,推动生物医学和生命科学的发展。