简介

CLUE数据库是一个以生物医学研究为重点的资源,提供全球最大的扰动驱动基因表达数据集。它允许研究人员探索和分析基因表达数据,以帮助解开生物学的复杂性。

主要功能

提供一个在线搜索框,使用户能够查找感兴趣的化合物、基因、作用机制或扰动类别的概述。

提供了一系列工具,包括应用程序,用于查询基因表达特征并分析结果连接。

更新了CMap LINCS基因表达资源,包含超过300万个基因表达概况和超过100万个复制塌陷特征。

主要特点

数据可从LINCS数据发布应用程序以及CLUE数据库下载。

提供外部基因集的数据查询功能。

提供Web应用程序查询元数据。

提供Python库,以便以编程方式访问数据。

提供代码库、笔记本和Docker容器,以帮助数据访问和分析。

数据和工具作为测试版发布,可能会随着小的更新而变化。

结论

CLUE数据库是一个强大的生物医学研究工具,它通过提供大量的基因表达数据和分析工具,支持研究人员深入探索生物学问题。尽管它目前处于测试版,可能会有所变化,但其提供的数据量和分析能力已经显示出其在生物医学领域的应用潜力。此外,该数据库已经宣布停止提供办公室时间和电子邮件支持,但用户仍然可以通过在线学习资源和Connectopedia获