简介

catRAPID 是一个由西班牙 Center for Genomic Regulation 的 Tartaglia Lab 研发的全面 RNA-蛋白结合预测网站。该工具以其强大的功能和较高的预测准确性而著称,能够预测 RNA-蛋白相互作用,尤其是在预测 NPinter 数据库中的非编码 RNA-蛋白相互作用方面表现出色。

主要功能

catRAPID fragments:评估多肽和核苷酸链的物理化学性质,如二级结构、氢键和范德华力。

catRAPID strength:评估蛋白质和 RNA 相互作用的强度。

catRAPID omics:计算模型生物分子(蛋白质/转录物)与参考集(转录物/核苷酸结合蛋白质)之间的相互作用。

catRAPID express:提供快速的 RNA-蛋白相互作用预测。

catRAPID signature:寻找 RNA 结合区,帮助识别 RNA 上的特定结合位点。

catRAPID interactions with large RNAs:将多肽和核苷酸序列划分为片段,预测整体的相互作用倾向。

结论

catRAPID 作为一个功能强大的 RNA-蛋白结合预测工具,通过其六个专业模块,为用户提供了从分子层面到整体相互作用的全面预测服务。它不仅适用于基础研究,也有助于推动生物医学领域的科学发现。