简介

mQTLdb 是一个专注于 meQTL预测的数据库,它基于对1000对母子在生命不同阶段(出生、儿童期、青春期、孕期、中年期)进行的大规模全基因组DNA甲基化分析而构建。这个数据库提供了丰富的 meQTL 数据,对于研究甲基化与遗传变异之间的关系具有重要价值。

数据来源

ARIES队列:mQTLdb 的数据主要来源于 Accessible Resource for Integrated Epigenomic Studies (ARIES),这是一个综合表观基因组研究的可访问资源,由作者团队长期跟踪的母子随访性队列。

主要功能

搜索功能:用户可以通过点击 "Search" 进入搜索界面。

输入SNP/甲基化位点:在搜索界面中输入想要分析的SNP或甲基化位点。

选择分析数据:根据需要选择相应的分析数据集。

选择时间点:选择想要分析的具体时间点。

定义cis-meQTL距离:设定分析时考虑的cis-meQTL的距离范围。

结果呈现:分析结果以表格形式展示,包括具体时间点、SNP和甲基化位点信息,以及分析后的P值。、

数据下载功能:mQTLdb 提供了数据下载功能,用户可以根据自己的需求下载相关数据集进行进一步分析或研究。

结论

mQTLdb 作为一个专注于 meQTL 预测的数据库,为研究者提供了一个宝贵的资源,特别是对于那些对表观遗传学和基因组学感兴趣的科研人员。它的用户友好界面和丰富的数据集,使得研究者能够方便地进行甲基化和遗传变异的关联分析。