简介

lncRNASNP2 是一个专注于预测单核苷酸多态性(SNP)对长非编码RNA(lncRNA)调控功能影响的数据库。这种影响可能涉及基因表达的调控、miRNA的结合以及在疾病中的潜在作用。

主要功能

lncRNA中SNP的影响预测:预测lncRNA中的SNP如何影响其本身的基因表达和功能。

miRNA结合影响分析:分析SNP对miRNA在lncRNA中的结合能力的影响。

癌症中lncRNA的突变与表达:提供TCGA(The Cancer Genome Atlas)项目中关于lncRNA在癌症中的突变情况和表达数据。

COSMIC数据库集成:整合COSMIC数据库中的数据,提供关于lncRNA的癌症相关体细胞突变信息。

突变影响预测:预测SNP突变对lncRNA功能和调控的潜在影响。

人类和老鼠:目前lncRNASNP2数据库支持对人类和老鼠的lncRNA进行分析。

用户可以通过数据库检索特定lncRNA上的SNP,并获取关于其功能影响的信息。

提供了用户友好的界面,使研究人员能够轻松访问和分析数据。

结论

lncRNASNP2数据库是一个宝贵的资源,它为研究者提供了一个平台,用以探索SNP对lncRNA功能的影响,尤其是在癌症和其他疾病背景下。通过整合多个数据库资源,lncRNASNP2提供了一个全面的分析工具,有助于深入理解lncRNA在生物学和疾病中的角色。