简介
Gene Expression Omnibus（GEO）数据库是一个由美国国立生物技术信息中心（NCBI）于2000年创建并维护的高通量基因表达数据库。
主要特点
国际公共存储库：GEO是一个全球性的公共存储库，供研究者上传和共享数据。
高通量数据收录：收录了包括微阵列芯片、二代测序等在内的高通量基因组数据。
免费下载：GEO数据库提供的数据可以免费下载，便于研究者使用。
数据类型多样：包括基因芯片数据和高通量测序数据，涵盖RNA、甲基化和SNP芯片数据等。
多物种和条件覆盖：数据类型涵盖了多种生物物种、组织和生理条件下的基因表达数据。
数据组织结构：分为Platforms（GPL）、Samples（GSM）、Series（GSE）和DataSets（GDS）四个基本实体类型。
Platforms：指高通量实验检测所用的工具，如芯片或测序平台。
Samples：指具体的样本数据。
Series：由多个样本构成的一个完整的研究数据集。
DataSets：GEO工作人员根据用户提交的数据整理后的数据集。
原始数据与处理数据：高通量测序的原始数据存储在SRA（Sequence Read Archive），处理后的数据存储在GEO中。
结论
GEO数据库作为一个高通量基因表达数据库，为全球研究者提供了一个宝贵的资源，用于存储、共享和分析基因表达数据。它的多物种、多条件下的数据覆盖，以及详细的数据组织结构，使得GEO成为生物医学研究领域中不可或缺的工具。随着高通量测序技术的发展，GEO数据库将继续扩展其数据范围，为科学研究提供支持。
