简介

国家基因组学数据中心(NGDC)是中国国家生物信息中心(CNCB)的重要组成部分,致力于提供丰富的数据库资源服务于全球学术界和工业界。

主要特点

多组学数据整合:随着多组学数据的快速积累,NGDC通过大数据归档、整合分析和增值策展,不断扩展核心数据库资源。

核心数据库更新:NGDC持续更新其核心数据库资源,以适应不断增长的生物信息学需求。

新资源开发:在过去一年中,NGDC开发了多个新的数据库资源,特别是在传染病和微生物学、癌症特征关联以及热带植物方面。

传染病和微生物学数据库:开发了如MPoxVR、KGCoV、ProPan等数据库,专注于传染病和微生物学研究。

癌症特征关联数据库:建立了ASCancer Atlas、TWAS Atlas、Brain Catalog、CCAS等数据库,用于癌症特征的关联研究。

热带植物数据库:开发了TCOD数据库,专注于热带植物的基因组研究。

全球健康威胁响应:鉴于猴痘病毒和SARS-CoV-2的全球健康威胁,NGDC构建了猴痘病毒资源,并频繁更新SARS-CoV-2基因组序列、变体和单倍型。

公开访问:所有资源和服务都是公开可访问的,便于全球研究者使用。

使用场景

生物医学研究:可以使用NGDC的数据库进行传染病、微生物学、癌症等相关研究。

基因组学分析:可以利用NGDC的资源进行多组学数据分析。

教育和培训:可以利用NGDC的数据库进行教学和培训活动。

结论

国家基因组学数据中心(NGDC)作为一个重要的生物信息资源提供者,通过其不断扩展和更新的数据库资源,为全球的生物医学研究和基因组学分析提供了宝贵的支持。特别是在传染病和癌症研究领域,NGDC的新开发数据库和对全球健康威胁的快速响应,显示了其在生物信息学领域的重要贡献。随着生物信息学技术的不断发展,NGDC将继续发挥其在数据整合和资源开发方面的关键作用。