简介

MetOrigin是一个综合性的代谢物数据库，它整合了来自7个不同代谢物数据库的资源，包括京都基因和基因组百科全书（KEGG）、人类代谢物组数据库（HMDB）、BIGG、ChEBI、食品数据库（FoodDB）、药物数据库（DrugBank）以及毒素和毒素靶标数据库（T3DB）。这个数据库旨在提供一个全面的代谢物信息资源，以支持代谢物研究和分析。

主要功能

代谢物整合：从不同的数据库中收集了共314915个代谢物。

来源信息：提供了191031种代谢物的来源信息，包括宿主、微生物群、共代谢、食品、药物和环境。

快速搜索：可以通过Quick Search功能，输入代谢物号和对应的代谢物ID类型（如KEGGID/HMDBID/Metabolite）进行快速检索。

反应和微生物信息：检索结果提供代谢反应和相关微生物的详细信息，包括各个分类层级的物种信息。

整合分析：MetOrigin能够对微生物和代谢物组数据进行整合分析。

可视化交互式应用：提供了一个可视化交互式的应用软件，便于用户进行分析和数据解读。

分析模式：提供了简单MetOrigin分析（SMOA）和深度MetOrigin分析（DMOA）两种分析模式，均提供可视化图形展示。

主要特点

多数据库整合：MetOrigin整合了多个数据库的资源，提供了一个统一的界面来访问广泛的代谢物信息。

非冗余数据：数据库中的代谢物数据是非冗余的，提高了数据的质量和可用性。

详细的代谢物来源：提供了详细的代谢物来源信息，有助于理解代谢物的生物学和环境背景。

用户友好的搜索和分析工具：MetOrigin提供了用户友好的搜索和分析工具，使得复杂的代谢物分析变得更加简单。

可视化展示：通过可视化的图形展示，MetOrigin帮助用户更直观地理解复杂的代谢物网络和微生物关系。

结论

MetOrigin数据库是一个强大的工具，它通过整合多个代谢物数据库的资源，为研究人员提供了一个全面的代谢物信息平台。它的快速搜索功能、详细的代谢物来源信息、以及可视化的分析模式，使得MetOrigin成为代谢物研究和微生物组分析的重要资源。