简介

MetaboLights 是一个由欧洲生物信息研究所(EMBL-EBI)维护的代谢组学研究数据库。该数据库旨在存储和共享代谢组学实验数据及其相关的元数据。它是一个开放访问的资源,允许研究人员提交和检索代谢组学数据。MetaboLights 覆盖了多种物种和实验技术,包括质谱(MS)和核磁共振(NMR)数据。

主要功能

数据存储:提供一个平台,用于存储和共享代谢组学实验数据。

数据检索:允许用户通过高级搜索功能检索数据库中的研究。

数据共享:支持数据的开放共享,以促进代谢组学领域的研究。

教育和培训:提供在线教程和课程,帮助用户有效使用 MetaboLights。

实验数据和元数据:存储原始实验数据和相关的元数据。

主要特点

跨物种和跨技术:支持多种物种和实验技术的数据。

结构和光谱数据:提供代谢物的结构和参考光谱。

生物学角色和位置:涵盖代谢物的生物学角色、位置和浓度。

标准化格式:使用 ISA(Investigation, Study, Assay)模型/标准。

质量保证:通过与 ChEBI(Chemical Entities of Biological Interest)等数据库的链接,确保数据质量。

结论

MetaboLights 是代谢组学领域的一个重要资源,它为研究人员提供了一个存储、检索和共享代谢组学数据的平台。通过使用 MetaboLights,研究人员可以更好地理解代谢物在各种生理和病理过程中的作用,促进代谢组学领域的发展。其开放的数据共享政策和用户友好的界面也促进了全球范围内的科研合作和知识传播。此外,MetaboLights 与多个领先期刊合作,被推荐为代谢组学研究的首选数据库。