简介
CellMarker 2.0 是一个由哈尔滨医科大学李霞教授团队开发的数据库,旨在提供人和小鼠不同组织中不同细胞类型的marker genes集合。自2018年首次发布以来,CellMarker 2.0 已经成为细胞生物学和单细胞研究领域的重要资源,特别是在细胞类型鉴定和单细胞数据分析方面。
主要功能
Home模块:提供直观的图形化界面,包括快速搜索栏和数据统计信息,以及链接到不同组织和细胞类型的marker基因。
Search模块:提供三种搜索模式,包括按细胞类型搜索、按marker基因搜索和快速搜索,满足不同的查询需求。
Browse模块:可以直接查看数据库中存储的数据资源,包括组织和细胞marker的矢量图,以及具体的组织和细胞marker列表。
Cell Tools模块:提供六种单细胞在线分析工具,包括细胞注释、细胞聚类、细胞恶性病变分析、细胞分化分析、细胞特征分析和细胞互作分析。
Download模块:提供数据下载功能,可以下载不同组织中不同细胞类型的细胞marker基因数据。
主要特点
数据丰富性:CellMarker 2.0 整合了大量人和小鼠的细胞marker基因数据。
用户友好的界面:数据库界面设计直观,易于快速上手和使用。
多功能在线分析工具:提供的在线分析工具进行单细胞数据的深入分析。
数据可视化:通过矢量图展示组织和细胞marker数目,提供了数据的直观展示。
数据下载:支持数据下载。
结论
CellMarker 2.0 是一个强大的数据库,它为单细胞研究和细胞生物学提供了一个全面的资源。通过提供丰富的数据、直观的用户界面、多功能的在线分析工具和灵活的数据下载功能,CellMarker 2.0 大大促进了细胞类型鉴定和单细胞数据分析的研究。