简介
scTPA（Single-cell Transcriptome Pathway Activity Analysis）是由温州医科大学苏建忠教授课题组开发的一款网络工具，专注于基于人类和小鼠生物途径激活的单细胞转录组分析和注释。该工具收集了大量不同功能和分类学分类的生物途径，旨在识别细胞类型注释和解释的关键途径特征，从而帮助研究人员从通路导向的角度更好地理解细胞类型和状态。
主要功能
途径激活评估：scTPA提供了四种不同途径激活评估方法的可执行代码，经过优化，运行时间显著减少。
单细胞通路激活谱分析：提供细胞聚类和注释、标记通路及其相关基因的识别。
数据上传与分析：在Home模块中，用户可以上传待分析的数据，其中细胞类型标签为可选项，其他为必填项。
结果检索：在Retrieve results模块中，用户可以根据Job ID或Email检索之前的分析结果。
联系方式：Contact模块提供了数据库维护团队的联系方式。
帮助与文档：Help模块包括数据库介绍、快速上手指南、结果导出方法以及其他相关信息。
主要特点
优化的计算效率：四种途径激活评估方法的代码优化，显著减少了运行时间。
全面的途径覆盖：收集了大量具有不同功能和分类学分类的生物途径，有助于深入分析。
用户友好的界面：提供了直观的用户界面和详细的帮助文档，方便快速上手。
灵活的数据分析：支持上传自己的数据进行分析，并提供了试分析数据。
结果可视化：提供了单细胞通路激活谱的分析和可视化。
结论
scTPA是一个强大的单细胞转录组分析工具，它通过提供优化的途径激活评估方法和全面的生物途径数据库，为研究人员提供了一个从通路导向角度理解细胞类型和状态的平台。其用户友好的设计和灵活的数据分析功能，使得scTPA成为单细胞数据分析领域的重要资源。
