简介

RBPsuite 是一个基于深度学习的在线服务器，专门用于预测 RNA-蛋白质（RBP）结合位点。这个工具利用先进的深度学习算法，能够高效地分析线性和环形 RNA 上的 RBP 结合位点，为研究 RNA 与蛋白质相互作用提供了强大的支持。

使用方法

选择 RNA 类型：用户首先需要指定输入的 RNA 序列是线性的还是环形的（circRNA）。

选择预测模型：根据 RNA 类型，选择相应的预测模型。

输入 RNA 序列：在提供的界面中输入或上传 RNA 序列。

提交分析：提交序列后，服务器将进行处理并跳转至结果页面。

主要特点

深度学习技术：RBPsuite 利用深度学习算法，对 RNA 序列进行精确分析。

序列分割与评分：将 RNA 序列分割成 101 核苷酸片段，并对每个片段与 RBP 之间的相互作用进行评分。

基序检测：进一步检测结合片段上的已验证基序，提供更准确的结合得分分布。

线性与环形 RNA 支持：分别使用 iDeepS 和 CRIP 模型预测线性 RNA 和 circRNA 与 RBP 的结合分数。

结果展示：结果显示输入 RNA 与所有 RBP 之间的相互作用得分，用户可以点击查看特定 RBP 的详细信息。

结论

RBPsuite 作为一个易于使用的网络服务器，为科研人员提供了一个强大的工具，用于预测 RNA 上的 RBP 结合位点。它的深度学习基础和用户友好的界面，使得复杂的生物信息学分析变得更加简单和高效。