简介

miRTarBase 是一个基于实验验证的 miRNA 绑定基因查询数据库，它为研究者提供了一个宝贵的资源，用以探索 miRNA 与其靶基因之间的相互作用。

主要特点

实验验证：miRTarBase 纳入了通过多种实验方法验证的 miRNA-靶基因相互作用，确保了数据的可靠性。

多物种覆盖：数据库包含人类、小鼠、大鼠以及其他物种的 miRNA 靶基因信息。

多种检测方法：包括荧光素酶检测、芯片检测、测序检测和 CLIP-seq 检测等。

miRNA 输入检索：用户可以通过输入 miRNA 来检索相关的靶基因信息，包括前体 miRNA，如 mir-122。

使用方法

检索：用户输入 miRNA 后，数据库会展示与该 miRNA 相关的所有结果，包括不同物种的相互作用。

详细信息：点击具体 ID，用户可以查看包括以下内容的详细信息：

1.miRNA 相关信息，包括前体和成熟体。

2.目标基因信息及预测的结合位点。

3.相关文献证据。

4.在 GEO 和 TCGA 等多个数据集中 miRNA 和 mRNA 表达的相关性。

5.miRNA 相关的网络图。

结论

miRTarBase 作为一个专注于 miRNA 靶基因相互作用的数据库，通过提供实验验证的数据和多物种覆盖，为研究者提供了一个强大的工具，以探索 miRNA 的调控作用和生物学功能。