简介
Rfam数据库是一个专门用于存储和分析非编码RNA（ncRNA）家族的数据库。ncRNA是一类不编码蛋白质的RNA分子，在细胞中担任着各种重要的功能，包括调控基因表达、维持细胞稳态和参与细胞信号传导等。Rfam数据库由欧洲生物信息研究所（EMBL-EBI）创建和维护，它提供了大量的ncRNA家族的信息和相关数据。
主要功能
家族搜索：可以根据序列或家族的关键词搜索数据库中的ncRNA家族，并获取与该家族相关的信息。
序列注释：帮助用户标注已知的ncRNA序列，并提供这些序列的结构信息。
结构预测：根据输入的ncRNA序列，预测其二级结构，并提供结构的可视化展示。
数据更新：Rfam数据库定期更新，以确保包含最新的ncRNA家族信息和数据。
提供多种格式的数据：包括fasta格式的序列信息和CM模型，通过infernal软件可以利用这些模型对RNA序列进行判断，从而分析RNA序列对应的family信息。
主要特点
家族分类：对ncRNA家族进行了分类和注释。目前，Rfam数据库中包含了超过2,500个已知的ncRNA家族，这些家族已经根据它们的结构和功能进行了分类。家族注释：每个ncRNA家族都有详细的注释信息，包括家族的名称、描述、结构特征和功能等。
结构预测：提供了许多ncRNA家族的二级结构预测数据。这些预测数据可以帮助研究人员理解ncRNA的结构和功能关系。
序列搜索：提供了一个方便的搜索工具，可以根据序列或家族名称来搜索ncRNA家族。
数据更新：Rfam数据库定期更新，以确保包含最新的ncRNA家族信息和数据。
结论
Rfam数据库是一个重要的ncRNA家族数据库，为研究人员提供了丰富的ncRNA家族信息和相关数据。通过使用Rfam数据库，研究人员可以更好地了解和研究ncRNA的结构和功能。Rfam数据库的更新和改进，使得RNA同源性检测更加准确和高效。此外，Rfam数据库的社区贡献机制也使得数据库能够不断扩充和更新，更好地服务于科研社区。
