简介

TargetScan数据库是一个广泛使用的生物信息学工具,专门用于预测microRNA(miRNA)的靶基因以及已知基因的靶miRNA。这个数据库为研究人员提供了一个宝贵的资源,以理解miRNA在基因调控中的作用,特别是在多种物种中的调控机制。

主要功能

miRNA靶基因预测:TargetScan能够预测已知miRNA的潜在靶基因。

基因靶miRNA预测:数据库还可以预测已知基因可能被哪些miRNA调控。

多物种分析:TargetScan收录了包括人类、大鼠、小鼠、线虫、果蝇、斑马鱼、牛、狗、鸡等多种物种的数据。

主要特点

科学验证的方法:TargetScan使用经过科学验证的算法来预测miRNA靶标,提高了预测的准确性。

用户友好的界面:数据库提供了一个直观的用户界面,可以轻松地进行靶标预测。

广泛的物种覆盖:支持多种物种的miRNA靶标预测,增加了数据库的适用性和广泛性。

持续更新:随着miRNA研究的进展,TargetScan数据库定期更新,以包含新的miRNA和靶基因数据。

实验验证参考:TargetScan提供的预测结果常被用作实验设计的起点,其预测准确性得到了实验验证的支持。

结论

TargetScan数据库是miRNA研究领域的一个重要工具,它提供了一个准确且用户友好的平台,用于预测miRNA的靶基因和已知基因的靶miRNA。跨物种的覆盖使得TargetScan成为一个多功能的资源,适用于多种生物学研究。