简介
EWAS Open Platform是由中国科学院基因组所（国家生物信息中心）开发的一个表观基因组关联研究资源开放平台。该平台旨在提供一个全面系统的资源和服务，包括数据浏览与下载、在线分析与可视化以及知识解释与验证。EWAS Open Platform整合了大规模的DNA甲基化芯片数据集，并提供了与一系列表型参数相关的DNA甲基化图谱，为表观遗传学研究提供了宝贵的资源。
主要功能
数据整合：整合了115,852个样本的DNA甲基化芯片数据集。
表型参数关联：提供DNA甲基化图谱关联组织特异性、年龄相关性、性别差异、生活习惯差异和人种族群特异性等多个维度的表型参数。
数据可视化分析：提供丰富的数据可视化分析服务，帮助用户探索性状和基因之间的层次关联。
EWAS Toolkit：提供EWAS知识图谱，能够将任何给定的性状/基因链接到其相关的基因/性状中。
相关系数计算：可以选择一种或多种方式来计算基因与性状之间的相关系数。
知识图谱页面：可以指定各种参数，如中心节点、显示的层数、每个节点的最大边数以及相关系数的计算方法，网络结构可以实时更新。
主要特点
大规模数据集：平台拥有大规模的DNA甲基化数据集，为研究提供了丰富的数据基础。
多维度表型参数：涵盖了多个维度的表型参数。
实时更新的网络结构：可以根据需要调节参数，网络结构能够实时更新。
持续更新的数据集：平台数据集还在持续不断增加更新中，未来会加入更多数据集信息，如组蛋白修饰、基因组高级结构等。
资助支持：该研究得到了中科院战略性先导科技专项、国家重点研发计划、国家自然科学基金等项目的经费资助。
结论
EWAS Open Platform是一个功能强大的表观基因组关联研究资源开放平台，它不仅提供了大规模的DNA甲基化数据集，还提供了多维度的表型参数关联分析和丰富的数据可视化工具。
