简介
Cistrome DB是一个专注于ChIP-seq(染色质免疫沉淀测序)和DNase-seq(DNA酶敏感性测序)数据的数据库,它提供了一个全面的资源,用于研究转录和表观遗传调控。这个数据库包含了大量的已发表的转录因子和组蛋白ChIP-seq数据,是研究基因表达调控程序和转录调控机制的宝贵资源。
主要功能
数据校正和分析:提供ChIP-seq和DNase-seq数据的校正和分析服务。
转录因子和组蛋白数据:包含大量的转录因子和组蛋白ChIP-seq数据。
基因表达程序研究:利用Cistrome DB数据,可以系统地研究基因表达程序和转录调控。
组织特异性和发育性研究:提供不同的细胞资源和实验条件。
质量控制指南:Cistrome DB还可以作为ChIP-seq和DNase-seq实验的质量控制指南。
主要特点
全面性:Cistrome DB是目前最全面的ChIP-seq和DNase-seq数据库之一。
数据丰富:收录了大量的转录因子和组蛋白相关样本,以及染色质开放性样本。
研究应用广泛:适用于多种生物学研究,包括转录调控、表观遗传学、组织特异性和发育生物学。
质量控制:提供实验质量控制的标准和指南。
用户友好:数据库设计考虑到用户需求,提供了易于使用的界面和查询工具。
结论
Cistrome DB是一个重要的生物信息数据库,它为研究转录和表观遗传调控提供了一个全面的数据资源。通过提供大量的ChIP-seq和DNase-seq数据,Cistrome DB使得研究者能够深入理解基因表达的调控机制,并进行组织特异性或发育性研究。