1.1组织保存液寄送样本
组织保存液应在4℃条件下保存(效期6个月,有沉淀/冻融后不可使用),切勿冻存;
寄样时,先将样本放入装有组织保存液的储存管中,组织尽量无菌放入液体中,组织保存液应当浸没组织,然后迅速盖紧加封口膜包装好。
组织保存液寄送样本小Tips:
Step1、首先准备一个泡沫箱和适量冰袋,注意请勿使用-80℃冰箱冰袋用于邮寄样本
Step2、标明样本名称,用适量的塑料泡沫对装有组织的保存液管进行包裹
Step3、确保管子包裹完好
Step4、用保鲜膜或者胶带封好
Step5、置于冰袋上,保证不和冰袋直接接触
Step6、找一些填充物进行填充,确保样本在其中不会过多震荡
注意:寒冷天气下,可借助保温桶等设备防止组织结冰;胰腺类样本注意使用特殊组织保护液;
大于0.2g实体瘤组织(如需进行流式分选,根据分选的要求样本量通常要大于0.6g),保护液能完全浸没组织为宜,一般样本1mL可保证浸没;
血液(全血)/骨髓血样本置于EDTA抗凝管中,人4mL(特殊治疗/疾病需6mL,冻存PBMC细胞量需5×106 cells),鼠1-2mL。
如样本量足够建议首次寄送时同一样本2-3管重复,以防万一;
需标明:样本名称,组织类型,离体时间,浸入组织保存液时间;
寄送时装有样本的储存管不能和冰袋直接接触,需用泡沫包裹,保证4℃左右的低温环境;
新鲜组织送样量
常规组织 | 常规肿瘤、器官组织等 | 绿豆大小 | 达到0.08g可以尝试有风险,细胞量可能偏少。 |
黄豆大小 | 正常,可以尝试,细胞量通常可以达到上机要求。 坏死类需适量提高送样量。 | ||
花生大小 | 正常,可以尝试,细胞量通常十分充足。 坏死类需适量提高送样量 | ||
腺体类肿瘤及癌旁(例乳腺、胰腺、肝脏、肾脏、肠道、性腺、卵巢、垂体等) | 花生大小 | 正常,可以尝试,细胞量通常十分充足,最少0.6g(3粒黄豆大小)。 胰腺类注意使用特殊组织保护液(胰腺/胰腺癌)。 | |
皮肤类 | 皮肤 | 花生壳大小 | 正常:要求送样量达到1g为宜,组织量大约为一个花生壳大小(1cm*2cm)。 疾病、坏死、角质化严重:要求送样量为正常的2倍,约2g,2cm*4cm。 |
脑组织类 | 脑 | 花生大小 | 人:400mg。 小鼠(成年):半脑。 |
骨组织样本 | 软骨类 | 花生大小 | 软骨组织需要1g(一颗中等花生米大小)以上的组织量,达到送样量通常消化后细胞量充足。 |
硬骨类 | 成人中指指甲大小(2-3块 | 硬骨组织需要10g以上的送样量,可事先用骨钳将组织处理成1cm*1cm左右的小块(10g大约2.5-3块左右),达到送样量通常消化后细胞量充足。 | |
血管类 | 人主动脉、肺动脉及静脉 | 花生壳大小 | 动脉:要求送样量达到1g为宜,组织量大约为一个花生壳大小(1cm*2.5cm)。 静脉:要求送样量为动脉的2倍,约2g,2cm*5cm。 |
小鼠血管 | 2根 | 数量若干根,总量达到6cm为宜。 | |
体液类、冲洗液类 | 脑脊液、胸水、腹水、滑膜液、肺泡灌洗液 | 15-50mL | 无菌取样,提取体液后,直接放入15ml或者50ml离心管中;冲洗液类建议100mL以上。并做好标记。由于此类样本细胞得率低,建议尽可能多提供。 样本寄送:置于4℃环境进⾏保存运输。 |
1.2 新鲜细胞悬液
(1)自选缓冲液需注意选用无钙、镁、EDTA等影响酶活性物质,官方推荐含0.04% BSA的PBS;
(2)细胞量尽量保证在1×106cells以上;
(3)如需流式分选,分选后目的细胞尽量保证在1×10^5cells以上;
(4)冰袋寄送(注意不要选择干冰), 寄送时装有样本的储存管不能和冰袋直接接触,需用泡沫包裹,保证4℃左右的低温环境;
1.3冻存细胞干冰寄送
(1)冻存细胞寄送方法
1)分离的细胞梯度冻存(程序降温仪或者异丙醇-80℃过夜后液氮保存);建议冻存密度3-6×10^6cells /mL(管),每管1mL;如细胞量足够建议首次寄送时同一样本2-3管重复,以防万一;
2)将液氮保存的细胞,干冰寄送,干冰量需充足;
3)细胞复苏后活率大于75%将直接进行上机,活率小于75%的细胞不建议上机;
注:细胞冻存请使用专用的细胞冻存管;建议首次寄送预实验时同一处理(每一个重复)送 2-3 份样本,以做备选;
(2)细胞冻存方法(如细胞尚未冻存,可提供如下冻存方法)
1)将制备好的单细胞悬液离心(300-500g,5分钟,4℃),去上清,细胞缓冲液重悬后计数(浓度700-1200 cells/μL),调整细胞总量5-10×106cells(冻存细胞风险较大);
2)备注:实验室需备台式冷冻离心机(水平转子15mL离心管适配器);注意试剂和仪器无菌,操作过程要求无菌操作;
3)对于活性大于80%的细胞进行离心(300-500g,5分钟,4℃),去上清,加入冻存液,重悬细胞,然后将1mL细胞悬液加入到细胞冻存管中,拧紧盖子;
4)将细胞冻存管放到程序降温盒中(推荐异丙醇冻存盒);将程序降温盒放入到-80℃,24小时后选择干冰寄送或者液氮保存;
5)干冰寄送:将细胞冻存管放到干冰中,冻存管做好标记(样本名称、冻存时间),选择干冰15-20公斤(夏季可以适度增加)。
1.4 冻存组织寄送(液氮速冻组织寄送抽核处理)
(1)组织样本要求:
一般组织建议0.2g-0.5g/管(如需进行流式分选,0.6-1g/管,不同组织有差异),组织液氮速冻,如样本量足够建议首次寄送同一样本2-3管重复,以作备用
若穿刺样本量少,则不质控直接抽核
(2)10x官网建议:在整个实验过程中RNA酶抑制剂浓度是1U/μL
风险提示:抽核后质控为显微镜观察,非定量判断,有一定误差;另外非哺乳动物细胞文献及标准比较少,对于单核测序来说,存在风险。
1.5 植物样本寄送
(1)植物样本要求 植物类样本支持原生质体制备与植物抽核制备,均需寄送活株。 寄送过程中可以使用木架固定培养瓶及幼苗,以保证运输途中植物完整性及状态的稳定性。
制备的目标组织量建议>2g,幼嫩组织优先,木质含量高的组织类型成功率不稳定。
(2)关于特殊样本类型
含淀粉样本(如甘薯、人参、三七、马铃薯等)无法进行原生质体制备,只能抽核处理; 对于抽核类样本,如样本涉及真菌侵染、细菌处理、病毒、虫害等处理,需要确认样本详细情况,是否存在寄生/残留,如有残留/寄生,则无法通过流式进行核悬液的纯化实验。
1.6 类器官组织寄送
送样建议:类器官细胞得率低,建议尽可能多提供,或进行预实验测试细胞得率
(1) 悬液类样本量:大于2x106 cells
(2) 离心后的沉淀样本量:黄豆大小,建议大于0.2g
(3) 新鲜样本寄送过程中建议使用类器官的完全培养基,冰袋寄送
(4)冻存组织建议尽量去除类器官培养基,液氮速冻
(5) 需提前确认类器官是否含有支架,如含支架,需提供支架材料的溶解方案或试剂
1.7 动物样本寄送
(1)常规样本
对于常规动物组织样本、血液等,上机要求和单细胞转录组捕获上机质检标准一致;
(2)非常规样本
对于非常规样本,诸如鱼类、贝类等,建议进行活体寄送,放置在养殖液体中,充氧寄送
1.8 FFPE样本寄送
(1)石蜡块:优先建议提供石蜡块(带卡槽),要求被包埋组织横截面积>0.5cm2,蜡块密封后冰袋寄送
(2)石蜡卷:要求石蜡卷现切现用,先送质检样本,质检合格后再送正式样本
质检样本要求:5µm厚度5-6卷,现切现用(7天之内),置于EP管内,密封后冰袋寄送;
正式样本要求:25um厚度4-6卷,现切现用(7天之内),每两张石蜡卷,置于一个1.5ml EP管内,密封后冰袋寄送,切片厚度不可减小,需保证石蜡卷完整性;
1.9 体液类/冲洗液类样本寄送
(1)送样建议:无菌取样,提取体液后,直接放入15ml或者50ml离心管中,冲洗液类建议100mL以上。并做好标记。
(2)样本寄送:置于4℃环境进⾏保存运输。