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综合库 基因组 转录组 代谢组 蛋白组 表观组 单细胞 微生物 其它
TTD
TTD
一个提供有关已知的治疗性蛋白质和核酸靶点的数据库
GDSC
GDSC
收集肿瘤细胞对药物的敏感度和反应
癌症
ChEMBL
ChEMBL
具有类药特性的生物活性分子数据库
DrugBank
DrugBank
整合药物靶点、药物作用、药物代谢和药物相互作用等多方面的数据
药物
gcType
gcType
一个用于微生物系统发育和功能研究的高质量类型菌株基因组数据库。
微生物
MASI
MASI
对微生物群-活性物质相互作用进行分类的集中式标准化数据库
微生物 药物
gutMDisoeder
gutMDisoeder
专注于整理人类和小鼠肠道微生物失衡（dysbiosis）相关文献和原始数据
微生物 肠道微生物
gutMGene
gutMGene
专注于提供人类和小鼠肠道微生物及其代谢产物靶标基因的综合资源
微生物 肠道微生物
Mouse Cell Atlas
Mouse Cell Atlas
使用单细胞测序确定小鼠器官细胞类型组成，构建小鼠细胞图谱
单细胞
DISCO
DISCO
整合不同样本、组织类型、疾病状态和实验平台的大规模单细胞数据
CancerSEA
CancerSEA
全面分析单细胞层面下癌细胞不同功能状态的数据库
单细胞 癌症
PanglaoDB
PanglaoDB
整合小鼠和人类单细胞RNA测序的数据库
单细胞
OpenAnnotate
OpenAnnotate
大规模基因组区域的染色质可及性注释工作的平台
表观组
ATACdb
ATACdb
表观组 ATAC-seq
ChIPBase
ChIPBase
ChIPBase数据库致力于研究转录因子结合位点和基序
表观组 转录因子
ChIP-Atlas
ChIP-Atlas
ChIP-Atlas收集整理了大量chip_seq数据，并基于这些原始数据进行了分析
GWAS Catalog
GWAS Catalog
包含所有已发表的全基因组关联研究（GWAS）的数据库
PRIDE
PRIDE
一个通过质谱测定的蛋白质表达数据的档案库。
蛋白组
Pfam
Pfam
一个专注于保守蛋白质家族和结构域的数据库。
蛋白组
AlphaFold DB
AlphaFold DB
存储和共享 AlphaFold 预测的蛋白质结构，预测蛋白质分子类型的三维结构。
蛋白组
PathBank
PathBank
一个存储、检索和共享代谢通路数据的平台。
代谢组 通路
LMDB
LMDB
收集和有关不同家畜物种中发现的小分子代谢物的详细信息。
代谢组
MetaboLights
MetaboLights
存储和共享代谢组学实验数据及其相关的元数据。
代谢组
Metabolomics Workbench
Metabolomics Workbench
提供代谢组学数据和元数据的国家和国际存储，同时还提供代谢组学分析工具和代谢物标准、方案、教程、培训等。
miRDB
miRDB
专门用于microRNA（miRNA）靶标预测和功能注释。
转录组 miRNA
Rfam数据库
Rfam数据库
一个专门用于存储和分析非编码RNA（ncRNA）家族的数据库
转录组 非编码RNA
RefSeq
RefSeq
RefSeq数据库提供注释的基因组、转录和蛋白质序列记录
转录组
IGSR
IGSR
GSR致力于收集、整合和提供全球人类遗传变异数据，以支持全球范围内的遗传学和医学研究
基因组 人类
gnomAD
gnomAD
用于研究人类遗传变异及其在不同人群中的分布
基因组 人类
Ensembl植物数据库
Ensembl植物数据库
Ensembl Plants包含多种植物基因组的详细注释，包括基因、转录本、蛋白质、保守区域等
基因组 植物
ETCM2.0
ETCM2.0
一个全面且详尽的中医药数据库，收录了大量的中医方剂、中成药、中药材以及相关成分信息。
TCMBank
TCMBank
提供有关中药、成分、疾病及其相应基因靶点的标准化信息
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