简介

GEPIA2 是由北京大学张泽民教授团队开发的一个数据库,旨在提供全面的基因表达分析和自定义数据分析工具。该数据库整合了来自 TCGA(The Cancer Genome Atlas)和 GTEx(Genotype-Tissue Expression)项目的数据,以弥补 TCGA 中正常样本数量不足的问题,并通过结合 GTEx 的正常组织样本,增强了数据分析的完整性。

主要功能

Expression Analysis(表达分析):基于 RNA-seq 表达量信息,进行分析

肿瘤类型分析

基因表达分析

肿瘤预后生存分析

Custom Data Analysis(自定义数据分析):支持用户上传本地癌症 RNA-seq 数据,与 TCGA 和 GTEx 的样本进行比较分析。

主要特点

无需编程知识:即使是没有编程经验的用户,也能轻松使用 GEPIA2 进行肿瘤方向的基因表达和预后分析。

差异分析:GEPIA2 支持对 TCGA 所有样本基因进行差异分析。

预后分析:提供预后分析功能,帮助研究者评估基因表达与患者生存之间的关系。

联合分析:GEPIA2 支持 TCGA 和 GTEx 数据的联合分析,提高了分析结果的准确性。

结论

GEPIA2 是一个功能强大的在线数据库,为研究者提供了一个简便的途径来分析肿瘤相关基因的表达和预后。它的用户友好界面和强大的分析工具,使得即使是没有编程背景的用户也能轻松进行复杂的生物信息学分析。