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STITCH
STITCH
STITCH 是一个在线数据库，专注于化学-蛋白质相互作用网络。它由欧洲分子生物学实验室（EMBL）开发，提供了一个全面的数据资源，用于研究化学物质与蛋白质之间的相互作用。
数据分析 组学数据
MAP
MAP
MAP是基于R的免费Web应用程序。用户可以通过单独运行模块或运行由多个模块组成的自定义工作流来挖掘数据,一站式执行几乎完整的代谢组学数据分析。
数据分析 组学数据
悟空云平台
悟空云平台
此平台基于R语言开发，目前含有230余个模块，旨在辅助您快速分析各类组学数据。 该平台含有数据前处理、统计分析、功能分析、可视化作图、医学数据分析、回归分析、 机器学习等模块。平台可时时展现结果，人机交互友好。
数据分析 组学数据
MicrobiomeAnalyst
MicrobiomeAnalyst
对微生物组数据进行全面的统计、功能和综合分析的在线网站
组学数据 微生物组
ExpressAnalyst
ExpressAnalyst
统一的基因表达数据分析平台，支持多种格式的基因表达数据导入，对不同来源的数据进行标准化处理，以确保分析的一致性，对基因进行功能注释，包括基因本体（GO）分类和通路分析。
分析平台 基因表达量
EPCOT
EPCOT
一种计算工具，使用 ATAC-seq 来推断表观基因组、转录组和高分辨率染色质接触图谱。为研究染色质可及性及其在基因调控中的作用提供了强大的分析平台。
组学数据 基因调控
NetworkAnalyst
NetworkAnalyst
Networkanalyst是一个进行基因表达分析和meta分析的在线可视化分析平台，可以进行比对、定量、基因表达差异分析和富集分析、蛋白相互作用分析、多个数据集整合分析，还可以绘制像PCA、蛋白互作网络图、热图、火山图、韦恩图等高颜值的图片。
组学数据 网络可视化
CoCoBLAST
CoCoBLAST
CoCoCoNet作为一种工具，用于识别保守的基因模块和比较共表达网络
组学数据
RStudio
RStudio
RStudio是一个专为R语言设计的集成开发环境（IDE），它是一个独立的开源项目，提供用户友好的界面，帮助用户更高效地编写、调试和运行R代码。
R
R
R 是一个用于统计计算和图形学的免费软件环境。它可以在各种 UNIX 平台、Windows 和 MacOS 上编译和运行。
UALCAN
UALCAN
综合癌症数据分析平台
组学数据
ATACdb
ATACdb
一个专注于预测人类染色体开放状态的数据库
组学数据
LncTarD
LncTarD
LncTarD 是一个综合资源，旨在提供实验支持的关键 lncRNA 靶标调控、其影响功能和 lncRNA 介导的人类疾病调控机制，以及基于单细胞 RNA-seq 和 RNA-seq/微阵列数据的几种基于 Web 的工具。
组学数据
TarBase
TarBase
miRNA靶标数据库
组学数据
miRTarBase
miRTarBase
miRNA靶标数据库
组学数据
OmicsAnalyst
OmicsAnalyst
多组学在线分析工具
组学数据
MetaboAnalyst
MetaboAnalyst
一个综合性的代谢组学数据分析平台
组学数据
VannoPortal
VannoPortal
一个综合性的SNP信息查询数据库
组学数据
STRING
STRING
分析已知蛋白之间和预测蛋白质之间相互作用的数据库
组学数据
RBPsuite
RBPsuite
基于深度学习的RNA-蛋白质结合位点预测的网站
组学数据
lncRNASNP2
lncRNASNP2
SNP对lncRNA调控影响数据库
组学数据
mQTLdb
mQTLdb
关于meQTL预测的数据库
组学数据
IntAct
IntAct
IncAct 是一个专注于蛋白相互作用预测的数据库
组学数据
catRAPID
catRAPID
一个功能强大的 RNA-蛋白结合预测工具。
组学数据
SHAMAN
SHAMAN
用于宏基因组数据（16S、18S、23S、28S、ITS 和 WGS）的差异分析
组学数据
NASQAR
NASQAR
NASQAR是一个基因组数据分析平台，它通过将多种测序数据的高级分析和可视化工具封装在一个直观的Web界面中，包括转录组数据预处理、RNAseq 分析（包括scRNAseq）、宏基因组学和基因富集等。
组学数据
BSA-Seq
BSA-Seq
流程化分析BSA-seq数据
组学数据
CReSCENT
CReSCENT
一个为单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据标准化分析设计的可视化网站。
组学数据
M2IA
M2IA
M2IA 是一个用于微生物组和代谢组数据集成分析的 Web 的网页。
组学数据
NeuCA
NeuCA
NeuCA 是 scRNA-seq 数据中的细胞注释工具。它是一种有监督的细胞标签分配方法，利用已知标签的现有 scRNA-seq 数据训练基于神经网络的分类器，然后预测感兴趣的单细胞 RNA-seq 数据中的细胞标签。
组学数据
GeneTerpret
GeneTerpret
GeneTerpret是一个创新的基因组变异解读平台，旨在简化和加速医学基因组测序工作中的变异解读流程。这个平台通过整合多个数据库和计算工具，提供了一个统一的解决方案，用以分类和解读基因组中发现的变异。
组学数据
CellDepot
CellDepot
CellDepot 包含来自 8 个物种和多种组织的 270 多个数据集，是一个集成的网络应用程序，可帮助探索单细胞 RNA-seq （scRNA-seq）数据集，并通过具有高级可视化和分析功能的友好用户界面比较各种研究的数据集。
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人生若只如初见
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